Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARGP13631 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARGP13631 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARGP13631 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARGP13631 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARGP13631 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARGP13631 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARGP13631 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARGP13631 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARGP13631 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARGP13631 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARGP13631 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARGP13631 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARGP13631 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARGP13631 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RARGP13631 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RARGP13631 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARGP13631 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARGP13631 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARGP13631 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARGP13631 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARGP13631 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARGP13631 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARGP13631 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RARGP13631 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARGP13631 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARGP13631 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARGP13631 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARGP13631 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARGP13631 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARGP13631 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARGP13631 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARGP13631 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARGP13631 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARGP13631 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARGP13631 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARGP13631 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARGP13631 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARGP13631 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARGP13631 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARGP13631 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARGP13631 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARGP13631 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARGP13631 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARGP13631 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RARGP13631 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARGP13631 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARGP13631 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms