Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VCANP13611 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCANP13611 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCANP13611 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCANP13611 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCANP13611 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCANP13611 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCANP13611 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCANP13611 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCANP13611 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCANP13611 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCANP13611 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCANP13611 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCANP13611 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCANP13611 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCANP13611 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCANP13611 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCANP13611 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCANP13611 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCANP13611 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCANP13611 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCANP13611 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCANP13611 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCANP13611 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VCANP13611 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCANP13611 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCANP13611 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCANP13611 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCANP13611 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCANP13611 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCANP13611 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCANP13611 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCANP13611 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCANP13611 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VCANP13611 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCANP13611 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCANP13611 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCANP13611 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCANP13611 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VCANP13611 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VCANP13611 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VCANP13611 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCANP13611 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCANP13611 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCANP13611 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VCANP13611 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VCANP13611 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VCANP13611 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VCANP13611 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VCANP13611 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCANP13611 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCANP13611 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCANP13611 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VCANP13611 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCANP13611 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCANP13611 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCANP13611 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms