Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYP2C9P11712 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP2C9P11712 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C9P11712 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms