Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ESRRAP11474 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESRRAP11474 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms