Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMIGD3P0DMS9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMIGD3P0DMS9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms