Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RD3LP0DJH9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RD3LP0DJH9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RD3LP0DJH9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms