Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS56P0CW18 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRSS56P0CW18 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS56P0CW18 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms