Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR29P0C7W0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRR29P0C7W0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRR29P0C7W0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms