Protein–RNA interactions for Protein: P09234

SNRPC, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPCP09234 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNRPCP09234 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNRPCP09234 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNRPCP09234 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms