Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC4P09017 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC4P09017 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms