Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTMAP06454 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTMAP06454 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTMAP06454 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTMAP06454 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTMAP06454 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTMAP06454 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTMAP06454 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTMAP06454 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTMAP06454 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTMAP06454 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTMAP06454 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTMAP06454 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTMAP06454 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTMAP06454 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTMAP06454 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTMAP06454 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTMAP06454 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTMAP06454 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTMAP06454 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTMAP06454 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTMAP06454 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTMAP06454 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTMAP06454 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTMAP06454 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTMAP06454 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTMAP06454 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTMAP06454 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTMAP06454 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTMAP06454 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTMAP06454 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTMAP06454 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTMAP06454 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTMAP06454 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTMAP06454 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTMAP06454 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTMAP06454 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTMAP06454 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTMAP06454 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTMAP06454 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTMAP06454 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTMAP06454 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms