Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDN1P05305 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDN1P05305 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDN1P05305 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDN1P05305 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDN1P05305 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDN1P05305 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EDN1P05305 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDN1P05305 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDN1P05305 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDN1P05305 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDN1P05305 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDN1P05305 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EDN1P05305 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDN1P05305 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDN1P05305 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDN1P05305 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDN1P05305 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EDN1P05305 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDN1P05305 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDN1P05305 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDN1P05305 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EDN1P05305 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EDN1P05305 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EDN1P05305 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EDN1P05305 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDN1P05305 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDN1P05305 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EDN1P05305 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDN1P05305 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDN1P05305 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDN1P05305 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDN1P05305 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDN1P05305 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDN1P05305 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDN1P05305 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDN1P05305 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDN1P05305 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDN1P05305 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDN1P05305 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EDN1P05305 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDN1P05305 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDN1P05305 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDN1P05305 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDN1P05305 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDN1P05305 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDN1P05305 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDN1P05305 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDN1P05305 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDN1P05305 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDN1P05305 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDN1P05305 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDN1P05305 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDN1P05305 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDN1P05305 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms