Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPN2P04844 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN2P04844 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN2P04844 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN2P04844 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN2P04844 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN2P04844 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN2P04844 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN2P04844 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPN2P04844 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN2P04844 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN2P04844 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPN2P04844 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN2P04844 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN2P04844 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN2P04844 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN2P04844 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN2P04844 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPN2P04844 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN2P04844 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN2P04844 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN2P04844 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPN2P04844 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN2P04844 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN2P04844 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN2P04844 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN2P04844 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN2P04844 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN2P04844 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN2P04844 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPN2P04844 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPN2P04844 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPN2P04844 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPN2P04844 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPN2P04844 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN2P04844 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN2P04844 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN2P04844 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN2P04844 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPN2P04844 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPN2P04844 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN2P04844 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN2P04844 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN2P04844 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPN2P04844 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPN2P04844 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms