Protein–RNA interactions for Protein: P04628

WNT1, Proto-oncogene Wnt-1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT1P04628 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT1P04628 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT1P04628 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT1P04628 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WNT1P04628 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
WNT1P04628 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT1P04628 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT1P04628 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT1P04628 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT1P04628 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT1P04628 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT1P04628 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT1P04628 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT1P04628 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT1P04628 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT1P04628 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT1P04628 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT1P04628 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT1P04628 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT1P04628 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT1P04628 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT1P04628 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT1P04628 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT1P04628 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT1P04628 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT1P04628 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT1P04628 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT1P04628 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WNT1P04628 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WNT1P04628 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WNT1P04628 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WNT1P04628 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WNT1P04628 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WNT1P04628 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WNT1P04628 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WNT1P04628 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WNT1P04628 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WNT1P04628 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms