Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
A1BGP04217 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
A1BGP04217 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
A1BGP04217 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A1BGP04217 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
A1BGP04217 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
A1BGP04217 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A1BGP04217 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A1BGP04217 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A1BGP04217 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A1BGP04217 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A1BGP04217 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
A1BGP04217 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
A1BGP04217 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
A1BGP04217 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A1BGP04217 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
A1BGP04217 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
A1BGP04217 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
A1BGP04217 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
A1BGP04217 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
A1BGP04217 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
A1BGP04217 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A1BGP04217 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A1BGP04217 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A1BGP04217 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
A1BGP04217 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A1BGP04217 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
A1BGP04217 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
A1BGP04217 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
A1BGP04217 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
A1BGP04217 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
A1BGP04217 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
A1BGP04217 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
A1BGP04217 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
A1BGP04217 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A1BGP04217 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
A1BGP04217 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
A1BGP04217 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A1BGP04217 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A1BGP04217 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A1BGP04217 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A1BGP04217 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A1BGP04217 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A1BGP04217 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
A1BGP04217 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A1BGP04217 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
A1BGP04217 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A1BGP04217 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A1BGP04217 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A1BGP04217 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A1BGP04217 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
A1BGP04217 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
A1BGP04217 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A1BGP04217 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
A1BGP04217 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A1BGP04217 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
A1BGP04217 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
A1BGP04217 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A1BGP04217 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A1BGP04217 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
A1BGP04217 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
A1BGP04217 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
A1BGP04217 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
A1BGP04217 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
A1BGP04217 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
A1BGP04217 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A1BGP04217 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
A1BGP04217 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A1BGP04217 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
A1BGP04217 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
A1BGP04217 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
A1BGP04217 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A1BGP04217 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A1BGP04217 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
A1BGP04217 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A1BGP04217 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
A1BGP04217 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
A1BGP04217 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A1BGP04217 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A1BGP04217 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
A1BGP04217 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
A1BGP04217 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
A1BGP04217 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
A1BGP04217 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
A1BGP04217 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
A1BGP04217 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
A1BGP04217 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
A1BGP04217 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
A1BGP04217 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
A1BGP04217 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
A1BGP04217 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
A1BGP04217 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
A1BGP04217 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
A1BGP04217 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A1BGP04217 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
A1BGP04217 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A1BGP04217 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
A1BGP04217 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A1BGP04217 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
A1BGP04217 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms