Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTNP04004 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTNP04004 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTNP04004 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTNP04004 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTNP04004 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTNP04004 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTNP04004 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTNP04004 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTNP04004 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTNP04004 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTNP04004 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTNP04004 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTNP04004 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTNP04004 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTNP04004 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTNP04004 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTNP04004 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTNP04004 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTNP04004 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTNP04004 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTNP04004 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTNP04004 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTNP04004 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTNP04004 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTNP04004 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VTNP04004 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTNP04004 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTNP04004 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTNP04004 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VTNP04004 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VTNP04004 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTNP04004 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTNP04004 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTNP04004 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTNP04004 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VTNP04004 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTNP04004 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTNP04004 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTNP04004 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTNP04004 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTNP04004 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VTNP04004 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTNP04004 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTNP04004 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTNP04004 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTNP04004 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms