Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DRAP01903 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DRAP01903 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRAP01903 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms