Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TIMP1P01033 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIMP1P01033 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIMP1P01033 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms