Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
F13A1P00488 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
F13A1P00488 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
F13A1P00488 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F13A1P00488 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F13A1P00488 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F13A1P00488 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F13A1P00488 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F13A1P00488 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F13A1P00488 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F13A1P00488 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F13A1P00488 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
F13A1P00488 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F13A1P00488 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
F13A1P00488 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
F13A1P00488 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
F13A1P00488 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
F13A1P00488 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
F13A1P00488 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
F13A1P00488 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
F13A1P00488 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
F13A1P00488 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
F13A1P00488 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
F13A1P00488 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F13A1P00488 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F13A1P00488 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F13A1P00488 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
F13A1P00488 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F13A1P00488 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
F13A1P00488 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F13A1P00488 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F13A1P00488 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F13A1P00488 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F13A1P00488 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F13A1P00488 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F13A1P00488 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F13A1P00488 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
F13A1P00488 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F13A1P00488 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F13A1P00488 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
F13A1P00488 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F13A1P00488 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
F13A1P00488 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
F13A1P00488 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
F13A1P00488 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F13A1P00488 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
F13A1P00488 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
F13A1P00488 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F13A1P00488 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F13A1P00488 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms