Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST3O95803 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDST3O95803 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST3O95803 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST3O95803 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST3O95803 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST3O95803 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST3O95803 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDST3O95803 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST3O95803 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST3O95803 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST3O95803 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST3O95803 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST3O95803 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST3O95803 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST3O95803 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST3O95803 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST3O95803 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST3O95803 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST3O95803 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST3O95803 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST3O95803 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST3O95803 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST3O95803 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST3O95803 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST3O95803 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST3O95803 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST3O95803 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST3O95803 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST3O95803 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST3O95803 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST3O95803 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST3O95803 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST3O95803 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST3O95803 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST3O95803 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST3O95803 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST3O95803 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST3O95803 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST3O95803 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST3O95803 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST3O95803 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST3O95803 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST3O95803 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST3O95803 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST3O95803 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST3O95803 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST3O95803 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST3O95803 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST3O95803 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms