Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE6O95741 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE6O95741 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms