Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNAP29O95721 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms