Protein–RNA interactions for Protein: O95718

ESRRB, Steroid hormone receptor ERR2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRBO95718 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ESRRBO95718 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ESRRBO95718 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ESRRBO95718 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms