Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLR1AO95602 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
POLR1AO95602 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.82■■■■□ 3
POLR1AO95602 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
POLR1AO95602 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLR1AO95602 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLR1AO95602 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLR1AO95602 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLR1AO95602 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
POLR1AO95602 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.82■■■■□ 3
POLR1AO95602 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.81■■■■□ 3
POLR1AO95602 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms