Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF12O95522 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRAMEF12O95522 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF12O95522 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms