Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDK2AP2O75956 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms