Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCNKO75909 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNKO75909 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNKO75909 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNKO75909 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNKO75909 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNKO75909 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNKO75909 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNKO75909 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNKO75909 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNKO75909 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNKO75909 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNKO75909 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCNKO75909 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCNKO75909 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNKO75909 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNKO75909 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNKO75909 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNKO75909 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNKO75909 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNKO75909 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNKO75909 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNKO75909 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNKO75909 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNKO75909 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNKO75909 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNKO75909 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms