Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN15O75808 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN15O75808 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN15O75808 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms