Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCATO75600 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCATO75600 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCATO75600 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCATO75600 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCATO75600 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCATO75600 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCATO75600 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCATO75600 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCATO75600 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCATO75600 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCATO75600 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCATO75600 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCATO75600 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCATO75600 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCATO75600 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCATO75600 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCATO75600 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCATO75600 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCATO75600 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCATO75600 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCATO75600 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCATO75600 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCATO75600 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCATO75600 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCATO75600 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCATO75600 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCATO75600 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GCATO75600 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCATO75600 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCATO75600 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCATO75600 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCATO75600 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCATO75600 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCATO75600 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCATO75600 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCATO75600 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCATO75600 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCATO75600 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCATO75600 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCATO75600 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCATO75600 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCATO75600 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCATO75600 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCATO75600 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCATO75600 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCATO75600 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCATO75600 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCATO75600 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCATO75600 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GCATO75600 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCATO75600 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCATO75600 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GCATO75600 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCATO75600 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCATO75600 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCATO75600 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCATO75600 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GCATO75600 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCATO75600 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCATO75600 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCATO75600 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCATO75600 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCATO75600 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCATO75600 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCATO75600 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms