Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JRKO75564 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JRKO75564 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
JRKO75564 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JRKO75564 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
JRKO75564 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JRKO75564 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
JRKO75564 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JRKO75564 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JRKO75564 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
JRKO75564 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
JRKO75564 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
JRKO75564 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
JRKO75564 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
JRKO75564 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
JRKO75564 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JRKO75564 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
JRKO75564 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
JRKO75564 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
JRKO75564 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
JRKO75564 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
JRKO75564 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
JRKO75564 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JRKO75564 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
JRKO75564 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
JRKO75564 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms