Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E2F6O75461 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E2F6O75461 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E2F6O75461 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F6O75461 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F6O75461 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F6O75461 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F6O75461 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F6O75461 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F6O75461 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F6O75461 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E2F6O75461 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F6O75461 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E2F6O75461 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2F6O75461 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2F6O75461 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2F6O75461 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2F6O75461 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms