Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPFIA4O75335 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIA4O75335 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIA4O75335 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms