Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM20BO75063 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms