Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GMDSO60547 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GMDSO60547 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GMDSO60547 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GMDSO60547 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GMDSO60547 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GMDSO60547 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GMDSO60547 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GMDSO60547 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GMDSO60547 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GMDSO60547 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GMDSO60547 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GMDSO60547 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GMDSO60547 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GMDSO60547 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GMDSO60547 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GMDSO60547 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GMDSO60547 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GMDSO60547 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GMDSO60547 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GMDSO60547 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GMDSO60547 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GMDSO60547 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GMDSO60547 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GMDSO60547 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GMDSO60547 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GMDSO60547 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GMDSO60547 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GMDSO60547 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GMDSO60547 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GMDSO60547 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
GMDSO60547 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMDSO60547 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMDSO60547 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMDSO60547 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GMDSO60547 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms