Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEMFO60524 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEMFO60524 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMFO60524 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMFO60524 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMFO60524 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMFO60524 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMFO60524 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMFO60524 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMFO60524 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEMFO60524 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEMFO60524 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEMFO60524 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEMFO60524 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEMFO60524 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEMFO60524 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEMFO60524 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEMFO60524 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMFO60524 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMFO60524 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMFO60524 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMFO60524 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMFO60524 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEMFO60524 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMFO60524 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMFO60524 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMFO60524 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMFO60524 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMFO60524 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMFO60524 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEMFO60524 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEMFO60524 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEMFO60524 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMFO60524 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMFO60524 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMFO60524 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMFO60524 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMFO60524 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMFO60524 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMFO60524 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEMFO60524 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMFO60524 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMFO60524 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMFO60524 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMFO60524 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEMFO60524 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEMFO60524 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEMFO60524 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEMFO60524 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEMFO60524 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEMFO60524 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms