Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP104O60308 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP104O60308 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP104O60308 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP104O60308 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP104O60308 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP104O60308 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP104O60308 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP104O60308 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP104O60308 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP104O60308 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP104O60308 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP104O60308 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP104O60308 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP104O60308 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP104O60308 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP104O60308 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP104O60308 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP104O60308 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP104O60308 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP104O60308 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP104O60308 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP104O60308 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEP104O60308 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEP104O60308 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP104O60308 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP104O60308 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP104O60308 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP104O60308 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEP104O60308 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEP104O60308 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEP104O60308 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEP104O60308 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEP104O60308 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP104O60308 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEP104O60308 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms