Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRICKLE3O43900 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRICKLE3O43900 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRICKLE3O43900 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms