Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKAB2O43741 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKAB2O43741 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PRKAB2O43741 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKAB2O43741 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRKAB2O43741 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKAB2O43741 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKAB2O43741 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRKAB2O43741 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKAB2O43741 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKAB2O43741 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKAB2O43741 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKAB2O43741 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKAB2O43741 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKAB2O43741 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKAB2O43741 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAB2O43741 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAB2O43741 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAB2O43741 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAB2O43741 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAB2O43741 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAB2O43741 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAB2O43741 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKAB2O43741 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAB2O43741 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAB2O43741 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAB2O43741 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAB2O43741 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAB2O43741 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAB2O43741 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAB2O43741 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKAB2O43741 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms