Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBFA2T2O43439 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBFA2T2O43439 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBFA2T2O43439 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms