Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI3O43414 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI3O43414 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERI3O43414 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERI3O43414 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERI3O43414 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERI3O43414 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERI3O43414 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERI3O43414 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERI3O43414 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERI3O43414 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERI3O43414 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERI3O43414 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERI3O43414 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERI3O43414 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERI3O43414 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERI3O43414 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERI3O43414 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERI3O43414 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERI3O43414 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERI3O43414 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERI3O43414 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERI3O43414 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERI3O43414 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERI3O43414 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERI3O43414 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERI3O43414 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERI3O43414 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERI3O43414 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERI3O43414 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERI3O43414 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms