Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPK2O43353 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK2O43353 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms