Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTIFO43310 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTIFO43310 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTIFO43310 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTIFO43310 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTIFO43310 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTIFO43310 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTIFO43310 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTIFO43310 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTIFO43310 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTIFO43310 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTIFO43310 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTIFO43310 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTIFO43310 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTIFO43310 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTIFO43310 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTIFO43310 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTIFO43310 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTIFO43310 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTIFO43310 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTIFO43310 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTIFO43310 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTIFO43310 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTIFO43310 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CTIFO43310 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTIFO43310 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTIFO43310 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTIFO43310 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTIFO43310 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTIFO43310 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTIFO43310 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTIFO43310 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTIFO43310 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTIFO43310 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTIFO43310 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTIFO43310 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTIFO43310 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTIFO43310 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTIFO43310 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTIFO43310 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTIFO43310 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTIFO43310 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTIFO43310 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTIFO43310 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTIFO43310 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTIFO43310 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTIFO43310 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTIFO43310 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTIFO43310 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTIFO43310 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTIFO43310 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTIFO43310 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTIFO43310 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms