Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PHGDHO43175 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHGDHO43175 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHGDHO43175 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms