Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEFVO15553 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEFVO15553 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEFVO15553 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEFVO15553 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEFVO15553 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEFVO15553 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEFVO15553 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEFVO15553 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEFVO15553 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEFVO15553 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEFVO15553 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEFVO15553 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEFVO15553 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEFVO15553 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEFVO15553 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEFVO15553 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEFVO15553 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEFVO15553 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEFVO15553 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEFVO15553 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEFVO15553 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEFVO15553 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEFVO15553 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEFVO15553 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms