Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSC2O15499 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSC2O15499 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSC2O15499 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSC2O15499 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSC2O15499 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GSC2O15499 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSC2O15499 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSC2O15499 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSC2O15499 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSC2O15499 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSC2O15499 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSC2O15499 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSC2O15499 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSC2O15499 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GSC2O15499 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSC2O15499 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GSC2O15499 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSC2O15499 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSC2O15499 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GSC2O15499 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSC2O15499 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSC2O15499 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSC2O15499 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSC2O15499 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSC2O15499 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms