Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPHB6O15197 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB6O15197 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms