Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZBTB39O15060 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBTB39O15060 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms