Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLGNO14967 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLGNO14967 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLGNO14967 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLGNO14967 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLGNO14967 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLGNO14967 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLGNO14967 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLGNO14967 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLGNO14967 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLGNO14967 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLGNO14967 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLGNO14967 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLGNO14967 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLGNO14967 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLGNO14967 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLGNO14967 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLGNO14967 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLGNO14967 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLGNO14967 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLGNO14967 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLGNO14967 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLGNO14967 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLGNO14967 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLGNO14967 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLGNO14967 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLGNO14967 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLGNO14967 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLGNO14967 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLGNO14967 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLGNO14967 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLGNO14967 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLGNO14967 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLGNO14967 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLGNO14967 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLGNO14967 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLGNO14967 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLGNO14967 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLGNO14967 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLGNO14967 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLGNO14967 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLGNO14967 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms