Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF5O14894 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TM4SF5O14894 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TM4SF5O14894 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms