Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CITO14578 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CITO14578 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CITO14578 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CITO14578 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CITO14578 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CITO14578 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CITO14578 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CITO14578 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CITO14578 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CITO14578 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CITO14578 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CITO14578 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CITO14578 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CITO14578 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CITO14578 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CITO14578 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CITO14578 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CITO14578 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CITO14578 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CITO14578 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CITO14578 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CITO14578 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CITO14578 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CITO14578 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CITO14578 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CITO14578 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CITO14578 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CITO14578 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CITO14578 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CITO14578 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CITO14578 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CITO14578 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CITO14578 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CITO14578 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CITO14578 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CITO14578 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CITO14578 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CITO14578 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CITO14578 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CITO14578 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CITO14578 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CITO14578 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CITO14578 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CITO14578 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CITO14578 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CITO14578 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CITO14578 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CITO14578 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CITO14578 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CITO14578 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CITO14578 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CITO14578 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CITO14578 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CITO14578 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CITO14578 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CITO14578 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CITO14578 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CITO14578 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CITO14578 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CITO14578 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CITO14578 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms